機構設置
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管理部門
辦公室 黨委辦公室 人事處（博士后科研工作站） 科技處（成果轉化處） 財務處 條件處
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科研部門
淡水魚類種質資源與生物技術研究室 漁業資源與環境研究室 水產養殖與遺傳育種研究室 魚類病害研究室 水產營養與飼料研究室 水產品檢測與質量安全研究室 水產信息與標準研究室
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掛靠機構
農業農村部淡水生物多樣性保護重點實驗室 農業農村部淡水魚類種質檢驗測試中心 農業農村部長江中上游漁業資源環境科學觀測實驗站 農業農村部水產品質量安全風險評估實驗室（武漢） 中國水產學會《淡水漁業》雜志社 全國水產標準化技術委員會淡水養殖分技委秘書處 農業農村部長江中上游漁業生態環境監測中心 農業農村部中華鱘保育和增殖放流中心 中國水產科學研究院淡水魚類育種與健康養殖重點實驗室 湖北省水產品質量安全工程技術研究中心 國家斑點叉尾鮰加工技術研發分中心（武漢）
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支撐部門
荊州基地 西南漁業研究中心 梁子湖基地 長江中上游漁業生態保護研究中心
荊州基地
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2023 09.19太湖試驗場
太湖試驗場是依托中國水產科學研究院長江水產研究所物種保護課題組的重要生產試驗基地，主要從事科學研究支撐及中華鱘、長江鱘等珍稀瀕危魚類的養殖、苗種培育、增殖放流和救護等工作。試驗場位于荊州市荊州區八嶺山鎮后湖畔，始建于1999年，現占地面...
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2017 11.22窯灣試驗場
? 窯灣試驗場修建于上世紀70年代初期，總占地面積213000平方米（折合約319.50畝），其中辦公樓3000平方米，實驗車間1500多平方米，具有池塘80多口，總水面面積180多畝；孵化車間3000多平方米；孵化四大家魚能力達5億尾、鯉鯽魚2億尾，能提供黃顙魚、大...
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