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    長江所在鱘魚性別特異性分子標(biāo)記開發(fā)方面取得新進(jìn)展

    作者:來源:淡水魚類種質(zhì)資源與生物技術(shù)研究室 發(fā)布日期:2021-12-14 09:37字體大小:【】【】【

      中國水產(chǎn)科學(xué)研究院長江水產(chǎn)研究所魚類生殖發(fā)育與細(xì)胞工程研究團(tuán)隊通過對施氏鱘雌雄群體進(jìn)行基因組重測序以及比較分析,篩選到施氏鱘雌性性別特異性DNA片段,并通過引物設(shè)計和群體驗證,表明所獲得的雌性性別特異性DNA分子標(biāo)記在鱘科魚類中具有通用性。相關(guān)研究成果近期在國際期刊《Genomics》(2021年影響因子為5.736)發(fā)表。
      鱘魚個體大、初次性成熟時間長,但未成熟鱘魚雌雄個體之間沒有明顯的第二性征,早期從形態(tài)上無法辨別雌雄。此外,經(jīng)濟(jì)型鱘魚(施氏鱘、俄羅斯鱘和雜交鱘等)加工的魚子醬富含人體必需氨基酸、多種不飽和脂肪酸、維生素等物質(zhì),營養(yǎng)價值極高,享有“黑色黃金”的美譽。因此,依照雌雄性別分別進(jìn)行集約化養(yǎng)殖或一定性別比例進(jìn)行飼養(yǎng),可以減少飼養(yǎng)過多雄性個體造成的資源浪費,節(jié)約養(yǎng)殖成本。此前其他科研人員通過ISSR、AFLP、RAPD和RAD等不同分子標(biāo)記技術(shù)檢測西伯利亞鱘、俄羅斯鱘、小體鱘、意大利鱘、湖鱘、波斯鱘和歐洲鰉、施氏鱘和中華鱘等鱘科魚類的雌雄個體基因組差異,都未能檢測到鱘魚的性別特異性DNA分子標(biāo)記。
      長江所魚類生殖發(fā)育與細(xì)胞工程研究團(tuán)隊通過高通量測序技術(shù),篩選雌雄特異性k-mers、含有特異性k-mer的reads進(jìn)行序列組裝,并對組裝后的序列進(jìn)行過濾、對獲得候選特異性片段設(shè)計引物進(jìn)行群體驗證,最后獲得了雌性性別特異性DNA分子標(biāo)記在施氏鱘、達(dá)氏鰉、中華鱘、達(dá)氏鱘、歐洲鰉、閃光鱘、俄羅斯鱘、西伯利亞鱘、小體鱘、大雜(達(dá)氏鰉♀×施氏鱘♂)和西雜(西伯利亞鱘♀×施氏鱘♂)等鱘科魚類中具有通用性。該研究結(jié)果不僅為監(jiān)測野生鱘魚種群性別比率及養(yǎng)殖鱘魚性別鑒定提供技術(shù)手段,而且也為鱘魚性別決定機(jī)制研究提供了基礎(chǔ),將對提高鱘魚性別鑒定準(zhǔn)確度,提早鱘魚性別鑒定年齡,助推鱘魚產(chǎn)業(yè)發(fā)展具有重要意義。
      該研究得到了中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院深圳農(nóng)業(yè)基因組研究所農(nóng)業(yè)基因組學(xué)技術(shù)研發(fā)與應(yīng)用創(chuàng)新團(tuán)隊的支持,同時獲國家重點研發(fā)計劃(2018YFD0900200)、國家自然基金(31702395)等項目的資助。該論文題目為“Screening and identification of female-specific DNA sequences in octaploid sturgeon using comparative genomics with high-throughput sequencing”,全文鏈接為https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0888754321003943

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