摘要:使用長PCR技術擴增鱘形目(Acipenseriformes)15個種的核糖體DNA(rDNA)18S rRNA基因與28S rRNA基因之間約2.5 kb的片段,并用7個限制性內切酶對該片段進行限制性位點分析。結果顯示,使用LATaqDNA聚合酶及GC Buffer結合長PCR技術能夠很好地擴增鱘形目魚類的rDNA。根據酶切圖譜可確定93個限制性位點,其中21個為保守位點,72個多態信息位點。HhaⅠ酶切的帶型在所有個體中完全一致,提示這些位點對保持rDNA的功能有重要作用。一些酶的酶切產物長度之和大于擴增產物的長度,暗示鱘形目魚類個體內存在多個rDNA等位基因。對種間遺傳距離進行計算,并構建UPGMA分子系統樹,發現鱘科魚類的系統關系與以往研究有較大差別,這可能是受個體內rDNA等位基因存在的影響,說明用酶切片段來重建鱘科魚類的系統樹不太可靠。文中還討論了高GC含量模板的PCR擴增和 rDNA在鱘形目分子系統關系中的使用。
附件下載:汪登強, 危起偉, 羅曉松等.
鱘形目魚類rDNA擴增及限制性位點分析. 中國水產科學. 2006,13(6):885-890